磷超標是引起水體污染的元兇之一。自然界中的磷分為兩類：可溶態或顆粒態。污水處理中的除磷就是把水中溶解性磷轉化為固態的磷，以達到分離的作用。利用微生物除磷是常見的方法之一，廢水在生物處理中,在厭氧條件下,聚磷菌的生長受到抑制,為了自身的生長便釋放出其細胞中的聚磷酸鹽,同時產生利用廢水中簡單的溶解性有機基質所需的能量,稱該過程為磷的釋放。進入好氧環境后,活力得到充分恢復,在充分利用基質的同時,從廢水中攝取大量溶解態的正磷酸鹽,從而完成聚磷的過程。將這些攝取大量磷的微生物從廢水中去除,即可達到除磷的目的。

聚磷菌在好氧條件下，分解機體內的PHB和外源基質，產生質子驅動力將體外的輸送到體內合成ATP和核酸，將過剩的聚合成細胞貯存物：多聚磷酸鹽（異染顆粒）。聚磷菌在厭氧條件下，分解體內的多聚磷酸鹽產生ATP，利用ATP以主動運輸方式吸收產酸菌提供的三類基質進入細胞內合成PHB。與此同時釋放出于環境中。

聚磷菌需完成上述一系列的生化活動，其活動受諸多方面的影響，影響因素包括：溫度、pH值、厭氧池DO、厭氧池硝態氮、泥齡。

一、溫度

生物除磷微生物包括嗜冷、嗜熱和中溫異養微生物，所以溫度對于生物除磷的影響不大，在一般水溫條件下，生物除磷都可以正常運行。Kang等人的研究表明，在A／O工藝中，當溫度在10℃以上時，生物的除磷效果不受溫度影響。

二、PH值

在pH在6.5一8.0時，聚磷微生物的含磷量和吸磷率保持穩定，當pH值低于6.5時，吸磷率急劇下降。當pH值突然降低，無論在好氧區還是厭氧區磷的濃度都急劇上升，pH降低的幅度越大釋放量越大，這說明pH降低引起的磷釋放不是聚磷菌本身對pH變化的生理生化反應，而是一種純化學的“酸溶”效應，而且pH下降引起的厭氧釋放量越大，則好氧吸磷能力越低，這說明pH下降引起的釋放是破壞性的，無效的。pH升高時則出現磷的輕微吸收。

三、溶解氧

厭氧區要保持較低的溶解氧值以更利于厭氧菌的發酵產酸，進而使聚磷菌更好的釋磷，另外，較少的溶解氧更有利予減少易降解有機質的消耗，進而使聚磷菌合成更多的PHB。而在好氧區需要較多的溶解氧，以更利于聚磷菌分解儲存的PHB類物質獲得能量來吸收污水中的溶解性磷酸鹽合成細胞聚磷。厭氧區的DO控制在0.2mg/l以下，好氧區DO控制在2mg/l以上，方可確保厭氧釋磷好氧吸磷的順利進行。

四、厭氧池硝態氮

厭氧區硝態氮存在消耗有機基質而抑制PAO對磷的釋放，從而影響在好氧條件下聚磷菌對磷的吸收。另一方面，硝態氮的存在會被氣單胞菌屬利用作為電子受體進行反硝化，從而影響其以發酵中間產物作為電子受體進行發酵產酸，從而抑制PAO的釋磷和攝磷能力及PHB的合成能力。每毫克硝酸鹽氮可消耗易生物降解的COD8.5mg，致使厭氧釋磷受到抑制，一般控制在1.5mg/l以下。

五、泥齡

污泥齡越小，除磷效果越佳。這是因為降低污泥齡，可增加剩余污泥的排放量及系統中的除磷量，從而削減二沉池出水中磷的含量。但對于同時除磷脫氮的生物處理工藝而言，為了滿足硝化和反硝化細菌的生長要求，污泥齡往往控制得較大，這是除磷效果難以令人滿意的原因。